Recientemente han surgido voces que atentan contra la labor del Foro Consultivo Científico y Tecnológico; primero reduciendo su financiamiento y luego excluyendo su participación en los órganos de toma de decisiones del sector de Ciencia, Tecnología e Innovación. La nueva Ley General de CTI deberá reconocer los espacios de participación pública existentes, como lo es el FCCyT.