Entre 2009 y 2017 el PEI apoyó casi 6 mil proyectos de investigación científica, desarrollo tecnológico e innovación con financiamientos complementarios y a fondo perdido. Esto quiere decir que los montos recibidos del Conacyt no buscan sustituir la inversión de la empresa, sino más bien, incentivarla y que el financiamiento no tiene obligaciones de retorno directo al Conacyt.